Protein–RNA interactions for Protein: Q99P88

Nup155, Nuclear pore complex protein Nup155, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup155Q99P88 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nup155Q99P88 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms