Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV1

Tdrd1, Tudor domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd1Q99MV1 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Tdrd1Q99MV1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tdrd1Q99MV1 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms