Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

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Length 392 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
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Sh3bp5lQ99LH9 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sh3bp5lQ99LH9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Sh3bp5lQ99LH9 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
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