Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.25□□□□□ -0.61
Higd1bQ99JY6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.25□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms