Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Tspan1Q99J59 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms