Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Rnf144aQ925F3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms