Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Med28Q920D3 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Zfp94-201ENSMUST00000032673 2529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Med28Q920D3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.7 ms