Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
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Smg8Q8VE18 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Smg8Q8VE18 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Smg8Q8VE18 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
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