Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ubxn4Q8VCH8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ubxn4Q8VCH8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
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