Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Dnajc28Q8VCE1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Dnajc28Q8VCE1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Dnajc28Q8VCE1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajc28Q8VCE1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajc28Q8VCE1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dnajc28Q8VCE1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Dnajc28Q8VCE1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.2 ms