Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Ccdc58Q8R3Q6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ccdc58Q8R3Q6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
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