Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1W8

Impg1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, mousemouse

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Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Impg1Q8R1W8 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Impg1Q8R1W8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Impg1Q8R1W8 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Impg1Q8R1W8 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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