Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZY9

Sf3b4, Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4Q8QZY9 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Sf3b4Q8QZY9 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.9 ms