Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Mtmr3Q8K296 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mtmr3Q8K296 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms