Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Gtf3c1Q8K284 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gtf3c1Q8K284 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Gtf3c1Q8K284 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gtf3c1Q8K284 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
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