Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Abcf3Q8K268 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Abcf3Q8K268 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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