Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI96

Clip4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip4Q8CI96 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Clip4Q8CI96 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Clip4Q8CI96 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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