Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cog3Q8CI04 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cog3Q8CI04 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.3 ms