Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc17Q8CE13 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc17Q8CE13 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms