Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ccdc38Q8CDN8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms