Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Nhlrc3Q8CCH2 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Nhlrc3Q8CCH2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
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