Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCF0

Prpf31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf31Q8CCF0 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Prpf31Q8CCF0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Prpf31Q8CCF0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms