Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Spef2Q8C9J3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Spef2Q8C9J3 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms