Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx17Q8BVL3 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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