Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKS9

Pum3, Pumilio homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 647 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pum3Q8BKS9 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Pum3Q8BKS9 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Pum3Q8BKS9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms