Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cyp4f39Q8BGU0 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms