Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Atg4bQ8BGE6 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Atg4bQ8BGE6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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