Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Q8BGC1 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms