Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
H2-M10.4Q85ZW8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
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