Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NanogQ80Z64 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NanogQ80Z64 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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NanogQ80Z64 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NanogQ80Z64 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NanogQ80Z64 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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