Protein–RNA interactions for Protein: Q80V62

Fancd2, Fanconi anemia group D2 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fancd2Q80V62 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Olfr1209-201ENSMUST00000099809 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fancd2Q80V62 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Trim26-202ENSMUST00000123715 1406 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Fancd2Q80V62 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms