Protein–RNA interactions for Protein: Q80UN9

Trit1, tRNA dimethylallyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trit1Q80UN9 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Trit1Q80UN9 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trit1Q80UN9 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms