Protein–RNA interactions for Protein: Q80UK0

Sestd1, SEC14 domain and spectrin repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sestd1Q80UK0 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sestd1Q80UK0 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sestd1Q80UK0 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms