Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Kcnf1Q7TSH7 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Kcnf1Q7TSH7 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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