Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Snd1Q78PY7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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