Protein–RNA interactions for Protein: Q71M36

Cspg5, Chondroitin sulfate proteoglycan 5, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspg5Q71M36 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cspg5Q71M36 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Cspg5Q71M36 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cspg5Q71M36 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cspg5Q71M36 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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