Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Timd4Q6U7R4 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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