Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
SvoplQ6PDF3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms