Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Zbtb40Q6PCS8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Zbtb40Q6PCS8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms