Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Rrp12Q6P5B0 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp12Q6P5B0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms