Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Y1

Rtl3, Retrotransposon Gag-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl3Q6P1Y1 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rtl3Q6P1Y1 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rtl3Q6P1Y1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.3 ms