Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms