Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXH3

Gpbp1, Vasculin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1Q6NXH3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gpbp1Q6NXH3 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms