Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
CltbQ6IRU5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
CltbQ6IRU5 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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