Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tpm4Q6IRU2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Tpm4Q6IRU2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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