Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atg9bQ6EBV9 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atg9bQ6EBV9 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms