Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Scaf8Q6DID3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Scaf8Q6DID3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms