Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Smarca2Q6DIC0 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smarca2Q6DIC0 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
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