Protein–RNA interactions for Protein: Q66JT1

Lrrc8e, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc8eQ66JT1 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lrrc8eQ66JT1 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Lrrc8eQ66JT1 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms