Protein–RNA interactions for Protein: Q62425

Ndufa4, Cytochrome c oxidase subunit NDUFA4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 82 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa4Q62425 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ndufa4Q62425 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Olfr607-202ENSMUST00000214347 5706 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Ndufa4Q62425 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
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